Alleli di rischio per la sclerosi multipla identificati mediante uno studio genomico
E’ stato condotto uno studio di associazione sull’intero genoma per identificare gli alleli associati al rischio di sclerosi multipla.
La tecnologia del DNA microarray è stata utilizzata per identificare varianti comuni di sequenza di DNA in 931 famiglie trio ( costituite da un figlio affetto dalla malattia e da entrambi i genitori ) e le stesse sono state valutate per associazione. Per le repliche sono stati genotipate altre 609 famiglie trio, 2.322 soggetti caso e 789 soggetti controllo e sono stati inoltre utilizzati i dati di due data set esterni di controllo.
E’ stata condotta un’analisi congiunta su 12.360 soggetti.
Un test TDT ( Transmission Disequilibrium Test ) su 334.923 polimorfismi a singolo nucleotide ( SNP ) in 931 famiglie trio ha rivelato 49 SNP, che mostravano un’associazione con la sclerosi multipla ( P
Un confronto tra i 923 soggetti caso provenienti dalle famiglie trio e 2.431 soggetti di controllo ha permesso di identificare altri 32 SNP non identificati in precedenza ( P
Sono stati inoltre selezionati altri 40 SNP con P value < 0.01 per un totale di 110 SNP per una analisi di secondo livello. Tra questi SNP, 2 all’interno del gene del recettore dell’interleuchina 2 ( IL2RA ) sono risultati fortemente associati alla sclerosi multipla ( P=2.96x10–8 ), così come un SNP non sinonimo nel gene del recettore dell’interleuchina 7 ( IL7RA ) ( P=2.94x10–7 ) e SNP multipli nel locus HLA-DRA ( P=8.94x10–81 ).
In conclusione, gli alleli di IL2RA e di IL7RA e nel locus HLA sono stati identificati come fattori di rischio ereditari per la sclerosi multipla. ( Xagena2007 )
The International Multiple Sclerosis Genetics Consortium N Engl J Med 2007; 357: 851-862
Neuro2007